本專業(yè)是首批國家級(jí)一流本科專業(yè)、國家特色專業(yè)、首批“卓越工程師”建設(shè)專業(yè)、教育部首批專業(yè)改革綜合試點(diǎn)專業(yè)、江蘇省品牌專業(yè)。
生物工程是當(dāng)代高科技的主要領(lǐng)域之一，是一門涉及基因工程、細(xì)胞工程、酶工程和發(fā)酵工程等多學(xué)科的工程技術(shù)學(xué)科。
江南大學(xué)的生物工程專業(yè)是全國最早設(shè)立的培養(yǎng)生物工程高級(jí)技術(shù)人才的專業(yè)之一，是以生物學(xué)（特別是其中的分子生物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)、生物化學(xué)和細(xì)胞學(xué)）的新理論和新技術(shù)為基礎(chǔ)，結(jié)合化工、機(jī)械、電子計(jì)算機(jī)等現(xiàn)代工程技術(shù)，可控地操縱遺傳物質(zhì)，定向地改造生物或其功能，以生產(chǎn)大量有用代謝產(chǎn)物或發(fā)揮它們獨(dú)特生理功能一門新興技術(shù)。該專業(yè)還設(shè)有“國家生命科學(xué)與技術(shù)人才培養(yǎng)基地班”，是在2002年同北京大學(xué)、清華大學(xué)等36所高校同時(shí)獲得的首批國家級(jí)人才培養(yǎng)基地。
此外，江南大學(xué)生物工程學(xué)院是中國發(fā)酵工程學(xué)科的誕生地，創(chuàng)建了我國第一個(gè)發(fā)酵工程國家重點(diǎn)學(xué)科，是我國工業(yè)生物技術(shù)領(lǐng)域，特別是發(fā)酵工程學(xué)科中，最具品牌影響力和競爭力的高等教育基地之一！
培養(yǎng)目標(biāo)：本專業(yè)培養(yǎng)適應(yīng)21世紀(jì)工業(yè)生物技術(shù)領(lǐng)域和社會(huì)發(fā)展需要的，德、智、體、美、勞全面發(fā)展的應(yīng)用型高級(jí)工程技術(shù)人才，擁有強(qiáng)烈社會(huì)責(zé)任感，理論基礎(chǔ)扎實(shí)、知識(shí)面廣、綜合素質(zhì)高，能在高等院校、相關(guān)科研機(jī)構(gòu)，或在輕工、醫(yī)藥、化工等行業(yè)從事生產(chǎn)、管理和新技術(shù)研究、新產(chǎn)品開發(fā)等工作。
主干課程：生物化學(xué)、微生物學(xué)、微生物遺傳育種學(xué)、酶工程、生化工程、發(fā)酵工程設(shè)備與工廠設(shè)計(jì)、發(fā)酵工程原理與技術(shù)、生物工業(yè)下游技術(shù)
畢業(yè)去向：畢業(yè)生可在生物工程與工業(yè)生物技術(shù)領(lǐng)域內(nèi)從事制藥、環(huán)保、氨基酸、有機(jī)酸、酶制劑、釀酒、酒精及高附加值生物制品的研究與開發(fā)、項(xiàng)目設(shè)計(jì)、生產(chǎn)管理、商品檢驗(yàn)、產(chǎn)品營銷與技術(shù)服務(wù)等工作，也可以考研或出國深造。本專業(yè)擁有發(fā)酵工程碩士學(xué)位授予點(diǎn)（全國第一批）、發(fā)酵工程博士點(diǎn)（國內(nèi)最早）、輕工技術(shù)與工程博士后流動(dòng)站，為畢業(yè)生提供進(jìn)一步深造的優(yōu)良條件。
近5年來，本專業(yè)共培養(yǎng)畢業(yè)生800多人，出國深造的比例為21%，到大中型企事業(yè)工作的比例為60%。另有近25名畢業(yè)生正在世界排名前200大學(xué)，如美國加州大學(xué)戴維斯分校、美國伊利諾伊大學(xué)芝加哥分校、美國普渡大學(xué)、美國華盛頓州立大學(xué)、美國約翰霍普金斯大學(xué)等國外高水平大學(xué)攻讀碩士學(xué)位。而在相關(guān)大中型企業(yè)中，如杰能科、克朗斯、Sealed Air、青啤、日本天野酶制劑株式會(huì)社、聯(lián)合利華和中糧等，也分布著大量本專業(yè)培養(yǎng)的技術(shù)骨干。本專業(yè)近三年的初次就業(yè)率均在98%以上。