生物工程專業(yè)培養(yǎng)掌握現(xiàn)代生物技術(shù)及其產(chǎn)業(yè)化的科學(xué)原理、工藝過程和工程設(shè)計等基礎(chǔ)理論、基本技能，具有良好的科學(xué)素養(yǎng)和創(chuàng)新能力，能在生物制藥、食品、能源化工及其他領(lǐng)域的企業(yè)或研究院所從事技術(shù)或生產(chǎn)管理等方面工作的人才。
本專業(yè)注重學(xué)生實踐教學(xué)和動手能力培養(yǎng)，專業(yè)課中實驗課的比例占40%-50%。經(jīng)過多年的辦學(xué)實踐，探索通過教師開展科學(xué)研究結(jié)合大學(xué)生創(chuàng)新實驗項目推動創(chuàng)新人才培養(yǎng)的模式，實現(xiàn)了科學(xué)研究、人才培養(yǎng)和科技創(chuàng)新培育的有機(jī)結(jié)合。在“本科生全程導(dǎo)師制”體系下，學(xué)院設(shè)計開展了以“育苗計劃-苗圃計劃-青林計劃”為主要內(nèi)容的拔尖創(chuàng)新型人才培養(yǎng)體系，學(xué)生從一年級開始就可以進(jìn)實驗室參與科研項目。學(xué)院專門成立了大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)實踐基地，通過參加“國家大學(xué)生創(chuàng)新實驗項目”、國內(nèi)外高水平的科技競賽和組織豐富多彩的科技活動提高學(xué)生的創(chuàng)新能力。近3年本科生先后組建隊伍赴美國參加國際遺傳工程機(jī)器大賽（iGEM）獲金獎2次，銀獎1次，銅獎1次；參加“全國大學(xué)生生命科學(xué)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽”獲得一等獎4次。本科生發(fā)表SCI高水平學(xué)術(shù)論文17篇。